Episode 3 วิญญาณของลาพลัส สหพันธ์ต้องการแย่งชิงยูนิคอร์นกันดั้มมาจากบานาจ จึงวางแผนลอบโจมตีพาเลา ฐานทัพของ "โซเดะสึกิ" การลอบโจมตีของหน่วยเอคอสกับการโจมตีด้วยปืนใหญ่อนุภาคของเนลอากาม่า ทำให้ท่าอากาศยานทางการทหารเป็นอัมพาต บานาจจึงถือโอกาสขับยูนิคอร์นกันดั้มหนีออกมา ในระหว่างที่กำลังหลบหนี เขาได้พบกับมิเนว่า เธออยู่กับรีดี้ที่ขับเดลต้าพลัสมา มิเนว่าต้องการลงไปที่โลกเพื่อทำตามปณิธานของตน บานาจเลือกที่ฝากชีวิตไว้กับมิเนว่า ระหว่างที่บานาจรีบเร่งกลับไปที่เนลอากาม่า มารีด้าก็ขับกษัตริยาเข้ามาขัดขวางเขาเอาไว้ การต่อสู้อย่างเอาเป็นเอาตายกับมนุษย์ดัดแปลงอย่างมารีด้า ทำให้ระบบ NT-D ของยูนิคอร์นกันดั้มเดินเครื่อง ผนึกพลังอันยิ่งใหญ่ได้ถูกเปิดออกแล้ว... ผลงานล่าสุดของตำนานศตวรรษแห่งอวกาศที่ประพันธ์โดยอาจารย์ฮารุโทชิ ฟุคุอิ "ยูนิคอร์น กันดั้ม" บทที่ 3 พลังลับที่แท้จริงของกันดั้ม ได้เริ่มขึ้นแล้ว
